Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWISTNBQ3B726 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms