Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C18orf21Q32NC0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf21Q32NC0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf21Q32NC0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf21Q32NC0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf21Q32NC0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf21Q32NC0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf21Q32NC0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf21Q32NC0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf21Q32NC0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms