Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC57Q2TAC2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms