Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSPP1Q1MSJ5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms