Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LAMA3Q16787 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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