Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRF1Q16656 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms