Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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