Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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