Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms