Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLR1Q15399 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLR1Q15399 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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