Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PDK3Q15120 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PDK3Q15120 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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PDK3Q15120 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PDK3Q15120 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PDK3Q15120 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PDK3Q15120 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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PDK3Q15120 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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