Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EEA1Q15075 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EEA1Q15075 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms