Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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