Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHPRHQ149N8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms