Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSPNQ14714 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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