Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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GBX1Q14549 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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GBX1Q14549 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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GBX1Q14549 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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GBX1Q14549 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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GBX1Q14549 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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GBX1Q14549 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
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