Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCARB2Q14108 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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