Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGB1Q14028 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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