Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCINQ13939 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCINQ13939 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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CCINQ13939 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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CCINQ13939 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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CCINQ13939 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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CCINQ13939 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCINQ13939 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCINQ13939 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCINQ13939 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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