Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1SQ13698 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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