Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL3Q13618 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL3Q13618 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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