Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PWP1Q13610 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PWP1Q13610 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms