Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC1Q13547 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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