Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRQ13535 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRQ13535 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRQ13535 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRQ13535 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRQ13535 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ATRQ13535 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ATRQ13535 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ATRQ13535 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRQ13535 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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