Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSLNQ13421 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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