Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE3BQ13370 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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