Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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