Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEMA3FQ13275 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3FQ13275 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms