Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NME3Q13232 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME3Q13232 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NME3Q13232 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NME3Q13232 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NME3Q13232 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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