Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPA4Q13156 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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