Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms