Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK2Q13002 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK2Q13002 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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