Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TP53BP1Q12888 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms