Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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