Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNMA1Q12791 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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KCNMA1Q12791 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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KCNMA1Q12791 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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KCNMA1Q12791 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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KCNMA1Q12791 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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KCNMA1Q12791 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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KCNMA1Q12791 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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KCNMA1Q12791 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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KCNMA1Q12791 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNMA1Q12791 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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