Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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