Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
HMGXB3Q12766 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
HMGXB3Q12766 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
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