Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSRP1Q08945 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms