Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms