Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PUDPQ08623 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms