Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CYP4F3Q08477 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms