Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA3Q08378 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA3Q08378 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms