Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FMODQ06828 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FMODQ06828 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
FMODQ06828 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FMODQ06828 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms