Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms