Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms