Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF9Q00978 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms