Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5Q00535 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5Q00535 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms