Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB1P82279 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CRB1P82279 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB1P82279 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB1P82279 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB1P82279 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms