Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RELNP78509 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RELNP78509 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RELNP78509 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELNP78509 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELNP78509 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELNP78509 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RELNP78509 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms