Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRX1P78414 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRX1P78414 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRX1P78414 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRX1P78414 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRX1P78414 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRX1P78414 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRX1P78414 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRX1P78414 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms